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朱巴航空公司是索马里的航空公司。此前，总部设在亚丁·阿德国际机场在摩加迪沙，索马里，现在是总部设在肯尼亚首都内罗毕，与其他各种全球性地区增设分支机构。它经营国产索马里境内客运和货运航班，以及为在中东目的地。朱巴航空是由两个位于卡尔加里的索马里企业家，说努尔Qailie和阿卜迪哈市Dalel成立于1998年。

1998年5月，该公司成立一个月后，航空公司开始了它的首次航行。这代表从沙迦摩加迪沙自1991年国有索马里航空公司已终止业务的第一个直达航班。截至2009年，朱巴航是注册在肯尼亚首都内罗毕。

它也有分公司，在索马里，吉布提，沙特阿拉伯，阿拉伯联合酋长国和乌干达。该航空公司在很大程度上填补了解散的索马里航空公司空出的利基，并经营国内客运和货运服务。提供在索马里的目的地，包括摩加迪沙，哈尔格萨，博萨索和加尔卡尤。到吉布提，阿联酋（迪拜），以及朝圣者朝觐吉达也是航空公司重要途径。此外，航空公司提供的货运航班。朱巴航空公司保持着自己的飞机，由工程师们是一个团队的300训练有素的员工中的一部分提供服务。承运人计划租赁更多的飞机，并打开新的分支机构，以提供更多的目的地到越来越多的乘客。在2015年2月，朱巴航空公司正式与达洛航空公司合并，组成了非洲联盟的航空公司。